耕鼎的生产基地位于台南科学园区，辖有两个工厂，分别为南科一厂与南科环东厂，厂房设施具国际水准且符合国际法规机构规范、制药产业的 PIC/s GMP规范。
耕鼎生技 - 南科环东厂
耕鼎生技 - 南科一厂
